Servizio APACHE e Servizio MySQL Server

Buongiorno ho installato diverse volte e su diverse macchine il VTECRM versione free e ho riscontrato il seguente problema:

Dopo un imprecisato numero di giorni i files dei servizi in oggetto spariscono dalle relative cartelle, impedendo ovviamente ai due servizi il regolare funzionamento.

Ora non mi spiego come sia possibile che due files che sono in uso essendo dei servizi ad avvio automatico possano essere cancellati o sparire in questo modo.

In oltre l'unico modo per poter ripristinare il funzionamento è quello di reinstallare il tutto con relativa perdita del database.

Avrei bisogno di un aiuto in merito in quanto sono diversi mesi che cerco di capire senza successo.

Grazie.